Сотрудниками поддерживаются связи со многими научными учреждениями СО РАН, вузами Сибири. Ботанический сад участвует в Международных проектах ПРООН/ГЭФ, Фонда дикой природы (WWF), республиканских конкурсах научно-исследовательских проектов и др.
Ежегодно ботанический сад посещают более двенадцати тысяч гостей из разных регионов России, ближнего и дальнего зарубежья. По экспозициям сада проводятся научно-познавательные экскурсии, реализуется посадочный материал.